Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms