Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms