Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms