Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RELNP78509 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RELNP78509 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RELNP78509 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELNP78509 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELNP78509 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RELNP78509 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RELNP78509 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms