Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms