Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms