Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RORCP51449 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RORCP51449 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RORCP51449 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms