Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DAP3P51398 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms