Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERFP50548 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERFP50548 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERFP50548 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERFP50548 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms