Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms