Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms