Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNPDA1P46926 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms