Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDIT3P35638 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms