Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms