Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.192e-8■■□□□ 14.5
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GTF2F1P35269 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.75e-11■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.755e-11■■□□□ 14.5
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GTF2F1P35269 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 415.38■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 511.55□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.487e-8■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 TF-204ENST00000461695 990 ntTSL 311.33□□□□□ -0.63e-29■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 TF-207ENST00000467842 4602 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.063e-29■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 324.86■■□□□ 1.578e-7■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.378e-7■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.38e-7■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 417.73■□□□□ 0.438e-9■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 TRIM8-202ENST00000462202 891 ntTSL 523.77■■□□□ 1.45e-7■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 TRIM8-204ENST00000487927 761 ntTSL 322.77■■□□□ 1.245e-7■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 522.33■■□□□ 1.179e-8■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.945e-7■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.929e-8■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.855e-7■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.245e-7■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-30■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.697e-9■■□□□ 14.4
GTF2F1P35269 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.547e-9■■□□□ 14.4
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GTF2F1P35269 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.932e-6■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 MELTF-205ENST00000473501 2757 ntTSL 225.32■■□□□ 1.648e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.488e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.457e-8■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 323.9■■□□□ 1.428e-7■■□□□ 14.3
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GTF2F1P35269 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.218e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 422.61■■□□□ 1.218e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 320.52■□□□□ 0.888e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-10■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.818e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 419.72■□□□□ 0.758e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 519.19■□□□□ 0.667e-8■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.518e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 317.4■□□□□ 0.388e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-213ENST00000531240 559 ntTSL 417.09■□□□□ 0.338e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-208ENST00000440228 620 ntTSL 416.89■□□□□ 0.298e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 216.64■□□□□ 0.258e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 ELMSAN1-205ENST00000435371 3839 ntTSL 1 (best)16.25■□□□□ 0.198e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.148e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.088e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 413.15□□□□□ -0.38e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-218ENST00000580745 535 ntTSL 412.6□□□□□ -0.398e-7■■□□□ 14.3
GTF2F1P35269 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.428e-7■■□□□ 14.3
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