Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms