Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms