Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRB3P28472 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms