Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms