Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms