Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms