Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRB1P18505 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB1P18505 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms