Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEFHP12036 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEFHP12036 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEFHP12036 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEFHP12036 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEFHP12036 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms