Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms