Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms