Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI3P10071 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms