Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLDN9O95484 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLDN9O95484 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLDN9O95484 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CLDN9O95484 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN9O95484 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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