Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms