Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms