Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNJ2O15056 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNJ2O15056 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNJ2O15056 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms