Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QRK9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QRK9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QRK9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms