Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
J3QR89 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
J3QR89 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
J3QR89 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
J3QR89 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
J3QR89 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
J3QR89 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
J3QR89 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
J3QR89 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms