Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L12C9JPN9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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USP17L12C9JPN9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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