Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms