Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms