Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVW-1Q9UQF0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms