Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms