Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms