Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms