Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms