Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLKQ9UBE8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms