Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOPCQ9HD26 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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