Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNA4Q9HCM2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNA4Q9HCM2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms