Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIN28AQ9H9Z2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIN28AQ9H9Z2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms