Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCL11BQ9C0K0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms