Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5DQ9BY66 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms