Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3GL2Q99962 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms