Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3R4Q99570 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms