Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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