Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARXQ96QS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms